学校团委下设办公室、组织部，宣传部，指导校学生会及校团委融媒体中心、校青春志愿者协会、校红十字会、校艺术团等4个团属校级学生组织。其中，校学生会涵盖学习部，体育部、外联部，实践部、社团管理部、志愿权益部等6个部门，社团方面，拥有包括中医研讨社、杏林药社、沧浪诗社、疾风骑行社、青沉音乐社、舞韵舞团、怀瑜汉文化社等五大类26支学生社团，为我校青年学生搭建了展示自我、培养能力的广阔平台。
校团委办公室
校团委办公室是处理综合事务，主要负责运行团委基本规章制度并统筹规划，协助团委内部日常顺利运作，是具有综合性和多功能性的协调和服务部门，在团委与各学生组织上传下达的服务性枢纽，是一个多功能性综合型部门。
校团委宣传部
校团委宣传部，既是学校团委的喉舌，更是展示学院风采、对内传达消息的有力臂膀。主要负责学校各种活动的宣传和推广，包括海报设计、视频剪辑，社交软件的传播与学校公众号的管理等。主要负责校团委会、学生会的所有宣传事宜。
校团委组织部
1.主要负责校团委与各系团总支之间的团学交流工作，协助校团委加强全校共青团思想建设、组织建设及共青团干部培养和管理。
2.负责团员材料的收集和存档，团费的收缴，新团员的发展，团员组织关系转接；负责优秀团员和优秀团干的评选、优秀班集体的评选，推荐优秀团员成为入党积极分子等工作。
3.负责学代会、团代会、班团一体化、三会两制一课、团支部工作手册、团支部书记述职测评制度、团支部整理整顿等团组织规范化建设的组织实施工作。
4.负责团校、“青年马克思主义者培养工程”等的组织实施；做好各级团学干部的选拔、教育、培训、换届、考核等工作。
校学生会6部：
学习部
对接学院教务老师，做一些收集材料、制表等工作。举办一些学习分享会、考研分享会、就业分享会等。举办中医相关知识比赛等，重点是负责学校学风建设以及举办学术活动的，为同学们营造良好的学习氛围。
志愿权益部
校志愿权益部是校学生会非常重要的一个部门，是以开展校内外各种丰富多样的志愿服务活动，积极响应社会热点，服务同学，奉献社会为宗旨，以服务广大学生为原则,同时收集反馈同学们提出的宝贵意见和建议对青协，红会具有监督管理职责，配合主席团以及其他部门工作等，做好学校，老师与同学间沟通的桥梁。
外联部
外联部是学生会的一个重要部门，外联部很大的一个作用就是联系工作，联系各个部门，联系学院，联系学校，联系校外。外联部最主要的任务就是为学生会和学生活动筹集资金，即拉赞助，从而保障学校活动的正常运转和进行。
实践部
实践部是组织学生开展丰富多彩的社会实践活动，提供锻炼学生的社会适应能力及沟通、决策、社交能力，使学生服务社会，奉献社会。协调和规范社会实践活动，为学生创造良好的社会实践环境和条件，并致力于提高在校学生的社会责任感与创新意识，协助培养适应社会发展需求的人才。
体育部
校体育部，作为常规部门，以协助学校做好特色工作为目标。策划组织开展一些大型体育活动。丰富同学们的业余生活，激发广大同学的兴趣爱好，培养学生德、智、体、美、劳全面发展的能力。
社团管理部
社团管理部是“自我管理，自我教育，自我服务”的学生组织，监管社团运作，引导社团动向，指导社团活动开展。 协调各社团之间关系，规范各社团的制度、活动，调动各社团的积极性，使各社团在统一管理下有序的开展工作。 我们的职责是主办全校各社团组织的活动赛事，社团的纳新活动，对各社团的运营发展进行监督帮助管理，积极配合学校各社团部门开展活动。如社团文化节、社团迎新工作、乒乓球社“青杏荣耀杯”比赛，中医研讨社“中医大赛”等活动。
团属校级学生组织：
校青春志愿者协会、校红十字会
我校为沈阳市高校志愿联盟发起单位，创新性成立全国首家高校“跟着庄仕华学雷锋志愿服务中队”,其中校青春志愿者协会、校红十字会定期组织开展社会实践志愿服务活动，服务单位包括辽宁省科技馆、辽宁省图书馆、辽宁省博物馆、“九·一八历史博物馆”“沈阳中街方城景区”、东北国际医院、沈阳“北市场”景区、沈阳市图书馆、辽宁省肿瘤医院在内的各类事业单位、医疗机构、著名景区等近20个，与各团区委联合深入社区、街道、乡村开展志愿服务及大学生社会实践活动，覆盖社区50余个。参与保障“沈阳国际马拉松”等大型国际赛事的医疗志愿服务工作。先进事迹被央视融媒体、辽宁日报、沈阳日报、百度新闻、新浪新闻等主流媒体报道百余次。
校艺术团
辽宁中医药大学杏林学院校艺术团主要负责学校每年的迎新晚会、毕业晚会等大型演出活动。下属八个部门 分别是：
8.乐队。是以各种乐器组合而成的部门，包括但不限于主唱、吉他、贝斯、键盘、鼓手，主要负责院里迎新晚会、毕业晚会等各种大小型的演出。参加各种各项比赛，可以充分展示自己的音乐才华，在舞台上闪闪发光。
校融媒体中心
辽宁中医药大学杏林学院校融媒体中心主要负责各类校团委媒体、影像资料的制作与宣传相关事宜。设主任、副主任统筹管理融媒体中心以及下列部门：
1.综合运营部。负责新媒体平台的推广工作，如公众号、抖音、微博，以及排版、审核、校对、推送、宣传、浏览等，并负责统筹全媒体宣传运行管理和宣传资料存档；承担与上级部门工作衔接和对内对外通联等工作。
2.策划部。确定宣传重点和选题策划，视频新闻文案、撰稿、新闻稿；负责编写视频脚本文案、全媒体新闻稿件文字编审以及召集融媒体中心编辑并落实工作部署。
3.影像采集部。负责各类影像素材采集、采访调度，提供融媒体新闻素材；负责对新闻信息来源记录处理。
4.编辑制作部。负责融媒体各种需要微信公众号、户外大屏等平台内容编辑制作和推送负责音视频、微电影、宣传片等播音主持、出镜和协助创作策划工作。
5.播音部。负责校内广播、栏目等相关事宜。
6.设备技术部。负责技术发展规划的编制和组织技术项目实施；负责设备技术管理和安全播出日常工作；各类前端设备等技术设备设施操作、维护、检修。
